我院朱天辉团队在国际期刊《Genomics》上发表题为“Whole-genome sequence ofArthrinium phaeospermum, aglobally distributedpathogenic fungus”的研究论文，获得了世界性病原真菌—暗孢节菱孢菌的全基因组及功能注释、次级代谢产物等信息，阐明了该菌系统进化、蛋白家族、特有基因等的特征，并掌握了致病过程的重要通路和关键效应因子。
暗孢节菱孢菌是由朱天辉研究团队2007年首次在省内大面积枯死的杂交竹上发现，该病原是一种广泛性病原菌，除对包括竹类在内的56种植物有强致病性外，还能造成动物和人皮肤大面积溃烂。团队现已完成该病害发生危害与分布规律、病原系统发育与致病机理、症状发生发展情况、综合防治措施等全面且系统性研究。然而，暗孢节菱孢菌在基因组及致病基因方面还有所欠缺。本论文通过PacBio RS II测序平台，获得暗孢节菱孢菌基因组大小48Mb，19个scaffold，19个contig，GC含量53%。通过NR、KOG、KEGG等数据库注释的共有基因有4731个，涉及基因最多的通路主要有：次生代谢产物的生物合成途径、抗生素生物合成途径、氨基酸生物合成途径等。在基因功能方面，分泌蛋白有1721个，次级代谢产物基因簇有66个，致病相关基因有3611个。在系统进化方面，基因家族有5886个，特有基因高达9686个，与Apiospora montagnei亲缘关系较近。本论文是节菱孢属真菌的第一个全基因组测序物种，研究结果有助于后续深入研究该属真菌系统进化、致病基因功能、次级代谢物调控途径等。
《Genomics》2019年影响因子为6.205。该论文以四川农业大学为第一和通讯单位，我院青年教师李姝江为第一作者，朱天辉为通讯作者，该研究得到国家自然科学基金青年基金项目、中国博士后基金、四川省科技厅基础应用研究项目资助。本研究团队一直致力于林木重大病害的病原及致病机理、病害生物防治方面的研究，近5年在中科院分区1区top期刊发表研究论文12篇。
全文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754318307341
