森保专业方馨玫博士在国际期刊《GENOMICS》上发表题为“Whole genome sequence of Diaporthe capsici, a new pathogen of walnut blight”的研究论文（2020-09）。Phomopsis capsici（Diaporthe capsici）是一种全球性植物病原菌，主要引起茄科植物病害，在木本植物上危害较少。朱天辉团队在四川广元、普格、南江、平昌、盐源核桃产业基地分离鉴定出核桃茎干病害新病原，该病原（P. capsici）可造成植株大量死亡，在国内外上尚未报道，其全基因组序列未被解析，基因功能编码不清楚，代谢途径也不明了。
本论文通过PacBio RS II测序平台，获得Phomopsis capsici 高质量reads 557399个、contig20个，最大组装长度8744971bp，N50的contig长度为5164495bp，组装后的样品GC含量为51.26%。预测到14425个编码基因，这些基因分别注释到了KEGG，KOG，NR，Pfam和Swiss-Prot等数据库中。目前在NCBI的Genbank数据库中还没有P. capsici的基因组信息，本次研究是P. capsici第一次基因组规模组装和注释，也是拟茎点霉属Phomopsis和间座壳属Diaporthe的第六个测序物种。
《GENOMICS》2019年影响因子为6.205。该论文以四川农业大学为第一和通讯单位，森保专业研究生方馨玫、秦楷为共同第一作者，朱天辉为通讯作者，该研究得到国家自然科学基金青年基金项目、中国博士后基金、四川省科技厅基础应用研究项目资助。方馨玫博士近两年以第一作者发表SCI研究论文 4 篇，累计影响因子17.6。
全文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754319310377
